一、按用途分類
按用途可分為兩大類。
1、工業(yè)潔凈室——以無生命微粒的控制為對象
主要控制無生命微粒對工作對象的污染，內(nèi)部一般保持正壓。它適用于精密工業(yè)、電子工業(yè)、宇航工業(yè)、化學(xué)工業(yè)、原子能工業(yè)、印刷工業(yè)、照相工業(yè)等部門。
2、生物潔凈室——以有生命微粒的控制為對象。
生物潔凈室又可分為：
（1）一般生物潔凈室，主要控制有生命微粒對工作對象的污染。同時(shí)其內(nèi)部材料要能經(jīng)受各種滅菌劑侵蝕，內(nèi)部一般保持正壓。其實(shí)質(zhì)上是結(jié)構(gòu)和材料允許做滅菌處理的工業(yè)潔凈室，可用于食品工業(yè)（防止變質(zhì)、生霉）、制藥工業(yè)（高純度、無菌制劑）、醫(yī)療設(shè)施（手術(shù)室、各種制劑室、調(diào)劑室）、動物實(shí)驗(yàn)設(shè)施（無菌動物飼育）、實(shí)驗(yàn)設(shè)施（理化、潔凈實(shí)驗(yàn)室）。
（2）生物學(xué)安全潔凈室（又稱生物安全實(shí)驗(yàn)室），主要控制工作對象的有生命微粒對外界和人的污染，內(nèi)部保持負(fù)壓。用于實(shí)驗(yàn)設(shè)施（細(xì)菌學(xué)、生物學(xué)潔凈實(shí)驗(yàn)室）、生物工程（重組基因、疫苗制備）

二、按氣流分類：
（1）單向流潔凈室；
（2）非單向流潔凈室（亂流潔凈室）
（3）輻（矢）流潔凈室；
（4）混合流（局部單向流）潔凈室；

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